本発明はゲノム上の目的の位置に塩基配列を挿入する方法を提供する。Recombination（遺伝子組替え）を行いたい箇所の塩基配列を取り入れるトランスファーカセットを用いるこの方法は、真核細胞の目的の箇所にターゲットとなる塩基配列（カセット内のそれに対応する塩基配列）を挿入し、対応した遺伝子配列部分でRecombination を促進するrecombinaseを使い、遺伝子組み替えを行う。この方法はランダムなDNA Recombinationを最小限に抑え、効率良く、ターゲット部分の遺伝子組み替えを可能にする。